המחלקה לאנדודונטיה (טיפולי שורש)של בית הספר לרפואת שיניים של האוניברסיטה העברית בירושלים והדסה עין כרם, הינה מחלקה אוניברסיטאית המשלבת טיפול קליני, מחקר והוראה.
מקצוע האנדודונטיה עוסק במניעה ובטיפול מחלות מוך השן. נזק בלתי הפיך ברקמת מוך השן מסתיים על פי רוב בביצוע טיפול שורש בשן הפגועה, הכולל את הסרת רקמת מוך השן שניזוקה.
התקדמות המחלה מתבטאת בהרס רקמות סב-חוד השורש ומחייבת טיפול אנדודונטלי. מגוון המצבים בהם נקרא מומחה לאנדודונטיה לטפל בהם הוא רחב וכך גם דרך וצורת הטיפול במקרים השונים.
הידע התאורטי והקליני הדרוש על מנת להתמודד בהצלחה עם המצבים הנ"ל, נרכש במסגרת תוכנית ההתמחות באנדודונטיה.
המחלקה נמצאת בקומה השנייה של בית הספר לרפואת שיניים וכוללת 6 חדרי טיפולים, ששופצו לאחרונה.
במחלקה ציוד טיפולי חדיש ומשוכלל הכולל מיקרוסקופ טיפולי בכל אחד מחדרי העבודה, לייזר, מכשור אולטראסוני, וכן מכשור לעבודה בפוצרי סבב, מכשירים שונים לדחיסה חמה ורנטגן דיגיטאלי.
אנדודונטיה עוסקת במניעה וטיפול במחלות של מוך השן ושל הרקמות הסב חודיות.